马成贵
2024-10-23 16:34:15
芯片包含新西兰、澳大利亚、美国、国际绵羊基因组协会及育种组织的主要亲子鉴定位点,利用国内外绵羊品种的重测序数据进行多态性位点补充,增添了绵羊Y染色体(NCBI登录号:CM022046.1)上的部分位点,同时选择支持可检测的绵羊多个已知重要性状候选基因及关键功能位点(含生长、屠宰、繁殖、毛色、角型、抗逆性等性状)组成功能芯片的核心SNP位点,共计1543个SNPs。
马成贵
2024-10-23 09:47:05
对274个样本进行遗传相似度两两比较,结果显示,样本A0328与A0328B、A1524A与A1524B、A1529与A1529B、A2127与A2127B、A1515与A1581样本之间相似度较高。
马成贵
2024-10-23 09:46:03
为研究放牧饲养的藏羊个体间的亲缘关系,对274只( 30只种公羊和234只子代)藏羊进行主成分分析,其SNP位点进行群体结构分析显示藏羊多样性相对较高,子代大部分样本可以分开。
马成贵
2024-10-22 11:14:07
使用GCTA软件(v1.92.4)进行亲缘关系分析,获得两样本间的亲缘关系矩阵。展示了任意两个体之间亲缘关系的远近,数值来表示亲缘距离,用此数值与系谱中记录的亲缘关系远近进行对照,看二者是否符合,记录符合的百分率
马成贵
2024-10-22 11:13:40
研究基于筛选后得到的SNP标记,使用 MEGA-X 软件进行 NJ 树的构建(模型:p-distance;bootstrap:1 000次)。