岳耀敬 2024-10-24 11:08:48

    以指定的种公羊为候选亲本，根据进化树遗传距离判断每个子代与亲本间的亲缘关系，以最小距离的一对作为亲子对。以种公ID：A00544为例，其遗传图谱结果如下图所示。

岳耀敬 2024-10-24 11:07:30

    从基因型检出率、均一性以及重复个体的基因型一致率等方面评估该芯片的性能。在11只羊的测试样本中，本产品检查的1543位点区段中的核心位点MAF平均值为0.29，结果入图5所示。发现检测结果的均一性（uniformity-rate（10%））为99.36%-99.55%，检出率为99.04%-99.30%。进行批次重复，重复个体的基因型一致率为99.74-100%。

岳耀敬 2024-10-23 16:49:54

    为了进一步分析藏羊个体间的亲缘关系，基于筛选后得到的 SNP 标记，使用 MEGA-X 软件进行邻接法构建274只藏羊系统进化树，结果显示每个种公羊对应的子代在树图中都有较好的区分。

岳耀敬 2024-10-23 16:34:15

    芯片包含新西兰、澳大利亚、美国、国际绵羊基因组协会及育种组织的主要亲子鉴定位点，利用国内外绵羊品种的重测序数据进行多态性位点补充，增添了绵羊Y染色体（NCBI登录号:CM022046.1）上的部分位点，同时选择支持可检测的绵羊多个已知重要性状候选基因及关键功能位点（含生长、屠宰、繁殖、毛色、角型、抗逆性等性状）组成功能芯片的核心SNP位点，共计1543个SNPs。

岳耀敬 2024-10-23 09:47:05

    对274个样本进行遗传相似度两两比较，结果显示，样本A0328与A0328B、A1524A与A1524B、A1529与A1529B、A2127与A2127B、A1515与A1581样本之间相似度较高。